奧林巴斯顯微鏡應用廣泛，不僅可醫療衛生單位、高等院校、研究所用于微生物、細胞、細菌、組織培養、懸浮體、沉淀物等的觀察，還可連續觀察細胞、細菌等在培養液中繁殖分裂的過程等。在細胞學、寄生蟲學、腫瘤學、免疫學、遺傳工程學、工業微生物學、植物學等領域中應用廣泛。
在奧林巴斯顯微鏡的使用過程中，其聚光鏡高低可以調節,使焦點落在被檢物體上,以得到較大亮度。一般聚光鏡的焦點在其上方1.25 mm處,上升限度為鏡臺平面下方0.1mm。因此載玻片厚度應在0.8~1.2 mm(標準厚度為1 mm)之間,否則會影響鏡檢效果。另外聚光鏡在使用中,一定要與所用物鏡相匹配,因為物鏡的分辨率受聚光鏡鏡口率的影響,物鏡的有效鏡口率等于物鏡的鏡口率加聚光鏡的鏡口率再除以2。如鏡口率為1.2的物鏡,與鏡口率為0.5的聚光鏡配合使用,則物鏡的有效鏡口率降低為0.85,因此,在實際使用中,原則上是聚光鏡的鏡口率應與所用物鏡鏡口率一致。聚光鏡鏡口率在1.0以上時,要用香柏油浸沒在聚光鏡上面鏡片與載玻片之間,以便使高倍物鏡發揮應有效力。觀察中,照明光線過強時,可以降低聚光鏡或縮小光圈,但這樣會降低顯微鏡的分辨能力,所以建議是調節燈源亮度,或利用深色濾光片。在觀察對比度小的標本(如活體標本或未染色標本)時,則需縮小聚光鏡的光圈,因為這樣可使明暗對比加大。但為了減小物鏡分辨率的降低,必須同時加強燈源光線強度。
用戶按照以上的方法能較好地調節奧林巴斯顯微鏡聚光鏡，且由于其采用雙通道光路，雙目鏡筒中的左右兩光束具有一定的夾角----體視角(通常為12—15度)，因而能形成三維空間的立體圖象。
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